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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-12 08:11:52, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Brassica napus genome assembly, chromosome: C03.
HG994367.1:41116918-41116942
TTCTGATTCGATATGAAAAGCTAAGGAAAT41116918TGGACAGTGGGACAGAACACACACACACAATGGTTGGTATGGCTGTGGTTGGTCA
BOMIQ55TR BO_2_3_KB Brassica oleracea genomic clone BOMIQ55, genomic survey sequence.
BH680498.1:327-351
TGACCAACCACAGCCATACCAACCATTGTG327TGTGTGTGTTCTGTCCCACTGTCCAATTTCCTTAGCTTTTCATATCGAATCAGAA
BONLO78TR BO_1.6_2_KB_tot Brassica oleracea genomic clone BONLO78, genomic survey sequence.
BZ431012.1:208-232
TGACCAACCACAGCCATACCAACCATTGTG208TGTGTGTGTTCTGTCCCACTGTCCAATTTCCTTAGCTTTTCATATCGAATCAGAA
BOOAD89TR BO_1.6_2_KB_tot Brassica oleracea genomic clone BOOAD89, genomic survey sequence.
BZ487581.1:611-635
TGACCAACCACAGCCATACCAACCATTGTG611TGTGTGTGTTCTGTCCCACTGTCCAATTTCCTTAGCTTTTCATATCGAATCAGAA
Brassica napus cultivar Xiang5A chromosome 18.
CP123893.1:38118700-38118724
TGACCAACCACAGCCATACCAACCATTGTG38118700TGTGTGTGTTCTGTCCCACTGTCCAATTTCCTTAGCTTTTCATATCGAATCAGAA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TGGACAGTGGGACAGAACACACACA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TGGACAGTGGGACAGAACACACACA | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.197 | 0.188 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TGGACAGTGGGACAGAACACACACA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.328 | 0.131 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TGTGTGTGTTCTGTCCCACTGTCCA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.331 | 0.003 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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