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データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-04-03 15:28:06, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Daucus carota subsp. sativus cultivar DH1 chromosome 2.
CP093344.1:48888185-48888204
TTGCCCTTGGCGAATTCAATGTTACCAAGA48888185TGGAGAATTGCAGCTACGACTTTAAAAATTGCTTCCTGAAAGGCGTGGGA
Fusarium venenatum strain A3/5 genome assembly, chromosome: I.
LN649229.1:3204954-3204973
TATCGGGATTGCCGTCAGAGATTGGGTACG3204954TGGAGAATTGCAGCTACGACGTAGACTGGTATTCTTTGCTTTAGGGTAGA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TGGAGAATTGCAGCTACGAC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TGGAGAATTGCAGCTACGAC | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.178 | 0.169 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TGGAGAATTGCAGCTACGAC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.261 | 0.084 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GTCGTAGCTGCAATTCTCCA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.261 | 0.000 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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