GGGenome Help | English

データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-04-03 16:11:23, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Musa troglodytarum cultivar karat chromosome 1.
CP097502.1:61041783-61041802
GTTTCTATATGTGAAACTGTATATGATATT61041783TGGCATACACGAAAGCATAAGTAGAGTTAAAGAGTTAAAAATTAATCTTT
Elaeis guineensis microsatellite DNA, clone mEgCIR0304.
AJ271931.1:142-161
AAGTGTGTGTGTGTGTGCGCGTGTTCATCT142TTATGCTTTCGTGTATGCCAC
Plagiodera versicolora genome assembly, chromosome: 1.
OY757524.1:29482172-29482191
AAAACAGAAAAAAATCCTCAATTTGAGTTT29482172TTATGCTTTCGTGTATGCCAACCAAATTCAACGAAATACATGGATAATAG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TGGCATACACGAAAGCATAA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TGGCATACACGAAAGCATAA | format : html | download : | debug :

0.008 | 0.008 | search_start;
0.156 | 0.148 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TGGCATACACGAAAGCATAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.239 | 0.082 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TTATGCTTTCGTGTATGCCA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.240 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).