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データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-05 21:01:44, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

TSA: Cannabis sativa PK15147.1_1.CasaPuKu mRNA sequence.
JP449748.1:377-396
ACTCTGTCAATGCGGTGTCGTTTGGGTTTG377TGGCCACTGCTATTCTCATATCCATGTTCCTTCTTATGGCTATTTTTGAG
Fagus sylvatica genome assembly, chromosome: 9.
OU015769.1:11925123-11925142
ACTCAGTGAATGCGGTGTCATTTGGGTTCG11925123TGGCCACTGCTATTCTCATATCAATGTTCCTTGTCATGGCCATCTTTGAA
Brachypalpus laphriformis genome assembly, chromosome: 2.
OX246754.1:149466087-149466106
TACAAAAACTTTACCATAAGAGTCCGTACC149466087TGGCCACTGCTATTCTCATAGTGTCTATGGAAGATTTTTCACCTACCCTC
TSA: Humulus lupulus var. lupulus mRNA, contig: comp236262_c0_seq1.
LA342515.1:427-446
CTCAAAGATAGCCATGAGAAGGAACATGGA427TATGAGAATAGCAGTGGCCACGAACCCAAACGACACCGCATTGACAGAGT
Humulus lupulus genome assembly, chromosome: 2.
OY720648.1:39735619-39735638
CTCAAAGATAGCCATGAGAAGGAACATGGA39735619TATGAGAATAGCAGTGGCCACGAACCCAAACGACACCGCATTGACAGAGT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TGGCCACTGCTATTCTCATA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TGGCCACTGCTATTCTCATA | format : html | download : | debug : 

0.008 | 0.008 | search_start;
0.344 | 0.336 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TGGCCACTGCTATTCTCATA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.491 | 0.147 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TATGAGAATAGCAGTGGCCA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=47
0.493 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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