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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 15:03:29, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Siphonodentalium dalli isolate Sc116.8C chromosome I.
CP136061.1:111140923-111140942
GTAACCTCATTCGGTTCCAGAGATATAAAT111140923TGGCCATGAAACCTATGTGAATTTGGTTCCTTTGAGTACCAACTGACCAC
Siphonodentalium dalli isolate Sc116.8C chromosome VI.
CP136066.1:178406836-178406855
ACCCATTCCTTTGGTTCCAGAGATATAAAC178406836TGGCCATGAAACCTATGTGAATTTTTGTTCCTTGGCGTATCTACTGGGCG
Siphonodentalium dalli isolate Sc116.8C chromosome IX.
CP136069.1:36429723-36429742
TTGGTGTAAATTCCTTCCAGAGAGATAACA36429723TGGCCATGAAACCTATGTGACTTTGTTCCGTGGAGAATTAACCGGTCACA
Daucus carota subsp. sativus cultivar DH1 chromosome 2.
CP093344.1:46995833-46995852
AGTAACCAAATGTACCAAGCACTCTAGCAG46995833TCACATAGGTTTCATGGCCATCTGGCATTAACTTTGCAAGCCCAAAATCC
Daucus carota isolate Kuroda chromosome 2.
CP125302.1:44883632-44883651
AGTAACCAAATGTACCAAGCACTCTAGCAG44883632TCACATAGGTTTCATGGCCATCTGGCATTAACTTTGCAAGCCCAAAATCC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TGGCCATGAAACCTATGTGA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TGGCCATGAAACCTATGTGA | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.184 | 0.175 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TGGCCATGAAACCTATGTGA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.290 | 0.107 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TCACATAGGTTTCATGGCCA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=47
0.292 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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