GGGenome Help | English

データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-04-03 14:56:41, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Peromyscus eremicus genome assembly, chromosome: 1.
OX460394.1:6542176-6542196
ATTGGAGCTTGTCCAGCAGGAGACCTCACA6542176TGGCTCTGACAACTGGAAATCCCCTTGCAGAGAGACACTGGTGGTGGTGGG
Peromyscus eremicus genome assembly, chromosome: 1.
OX460466.1:6510569-6510589
ATTGGAGCTTGTCCAGCAGGAGACCTCACA6510569TGGCTCTGACAACTGGAAATCCCCTTGCAGAGAGACACTGGTGGTGGTGGG
Solanum melongena mRNA, clone: SmFL03O10, 5'end.
FS068867.1:145-165
TCTCTTCAATTCCACCCGCAAAAAGTTCAA145GATTTCCAGTTGTCAGAGCCATTTCTGATGGGGAATACTCTTCCAAGAGGA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TGGCTCTGACAACTGGAAATC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TGGCTCTGACAACTGGAAATC | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.171 | 0.162 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TGGCTCTGACAACTGGAAATC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.342 | 0.170 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GATTTCCAGTTGTCAGAGCCA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.343 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).