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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-12 07:39:46, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Arachis hypogaea DNA, clone: SACT09L19.
DH964336.1:64-83
TACTCAAGCTTAGATGGGAAGGGAAAGCAG64TGGTGATATGGAACAGTGGCTGAATAAGATGGCTTCAGAACCATACTACC
Cardamine chenopodiifolia genome assembly, chromosome: 20.
OZ000478.1:14948847-14948866
ATCCATCTTAAAAAGATTCTGTTTTTCTTT14948847TGGTGATATGGAACAGTGGCAAGGAGTGGTGTATCCTCTTCTATTGACCT
Diaperis boleti genome assembly, chromosome: 2.
OY757244.1:13784307-13784326
AGTGGGTGTTATTGTTCACCTTTGTTATAT13784307TGGTGATATGGAACAGTGGCACTGTTAAATACAGACCCGTTTTCTTCTCA
Arachis hypogaea DNA, clone: AHGS40P15.
DH961609.1:292-311
GGTAGTATGGTTCTGAAGCCATCTTATTCA292GCCACTGTTCCATATCACCACTGCTTTCCCTTCCCATCTAAGCTTGAGTA
Arachis hypogaea cultivar Shitouqi chromosome B08.
CP031000.1:12292294-12292313
GGTAGTATGGTTCTGAAGCCATCTTATTCA12292294GCCACTGTTCCATATCACCACTGCTTTCCCTTCCCATCTAAGCTTGAGTA
Arachis ipaensis cultivar K30076 chromosome 08.
CP049899.1:11899341-11899360
GGTAGTATGGTTCTGAAGCCATCTTATTCA11899341GCCACTGTTCCATATCACCACTGCTTTCCCTTCCCATCTAAGCTTGAGTA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TGGTGATATGGAACAGTGGC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TGGTGATATGGAACAGTGGC | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.388 | 0.378 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TGGTGATATGGAACAGTGGC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.505 | 0.118 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GCCACTGTTCCATATCACCA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=47
0.508 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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