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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-12-16 22:08:20, GGGenome : DDBJ release 138.0 (Jun, 2025)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Cuc1_2_D03 Cucumber fruit development cDNA library Cucumis sativus cDNA, mRNA sequence.
DN909316.1:94-113
ACAAAGTGATGAGCATTGAGCAGTCACGAG94TGGTGGTGGGACTCCACTATTCTAATTACTTAGCTTATTCTCCCAGAGAA
TSA: Cucumis sativus var. sativus cultivar Vlaspik CuSa200910_13811, mRNA sequence.
JW931916.1:73-92
ACAAAGTGATGAGCATTGAGCAGTCACGAG73TGGTGGTGGGACTCCACTATTCTAATTACTTAGCTTATTCTCCCAGAGAA
Chelon labrosus genome assembly, chromosome: 15.
OY741303.1:27092880-27092899
GGATTTCAGCGAAAACTGCGCATGCGTCAT27092880TGGTGGTGGGACTCCACTATCGAAGCGTTGCTCAATGTGTTCGGTGCTCC
TSA: Cucumis sativus var. sativus cultivar Vlaspik CuSa200910_3198, mRNA sequence.
JW921367.1:1408-1427
TTCTCTGGGAGAATAAGCTAAGTAATTAGA1408ATAGTGGAGTCCCACCACCACTCGTGACTGCTCAATGCTCATCACTTTGT
Mellicta parthenoides genome assembly, chromosome: 10.
OZ178893.1:17607568-17607587
ATAAAAGGAAATACATATATTCGTCAACCC17607568ATAGTGGAGTCCCACCACCACCACTACAGCCTATCACAGTCCACTGTTGG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TGGTGGTGGGACTCCACTAT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TGGTGGTGGGACTCCACTAT | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.421 | 0.412 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50800/match?q=TGGTGGTGGGACTCCACTAT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.560 | 0.139 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50800/match?q=ATAGTGGAGTCCCACCACCA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=47
0.561 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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