GGGenome Help | English

データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 14:51:47, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Lotus japonicus genomic DNA, chromosome 2, clone: LjB04A13, BM1375.
AP010506.1:15303-15326
AGATATATGTAATATGTTAGATATCATTTC15303TGTCAGGTATCATACTAAACCAATGATAATGTGTTAGAATAAAAATAAAATGAA
Lotus japonicus genomic DNA, chromosome 2, clone: LjT02P19, TM0695.
AP007523.2:69583-69606
TTCATTTTATTTTTATTCTAACACATTATC69583ATTGGTTTAGTATGATACCTGACAGAAATGATATCTAACATATTACATATATCT
Lotus japonicus B-129 DNA, chromosome 2, complete sequence.
AP022630.1:87626351-87626374
TTCATTTTATTTTTATTCTAACACATTATC87626351ATTGGTTTAGTATGATACCTGACAGAAATGATATCTAACATATTACATATATCT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TGTCAGGTATCATACTAAACCAAT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TGTCAGGTATCATACTAAACCAAT | format : html | download : | debug : 

0.008 | 0.008 | search_start;
0.372 | 0.363 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TGTCAGGTATCATACTAAACCAAT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.474 | 0.102 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ATTGGTTTAGTATGATACCTGACA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.476 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).