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データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-04-06 11:47:38, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Lotus japonicus genomic DNA, chromosome 2, clone: LjT48O14, TM0467.
AP007374.2:54351-54371
AAATGTCAATTTTTCTTAAGGTTTAATTAA54351TGTTGACTTCTTTTAGGGTTGATAAATTTAATTATTGTTAAATATATATAT
Lotus japonicus genomic DNA, chromosome 2, clone: LjB24P14, BM1721.
AP010344.1:60859-60879
AAATGTCAATTTTTCTTAAGGTTTAATTAA60859TGTTGACTTCTTTTAGGGTTGATAAATTTAATTATTGTTAAATATATATAT
Lotus japonicus B-129 DNA, chromosome 2, complete sequence.
AP022630.1:76275905-76275925
ATATATATATTTAACAATAATTAAATTTAT76275905CAACCCTAAAAGAAGTCAACATTAATTAAACCTTAAGAAAAATTGACATTT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TGTTGACTTCTTTTAGGGTTG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TGTTGACTTCTTTTAGGGTTG | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.358 | 0.349 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TGTTGACTTCTTTTAGGGTTG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.462 | 0.104 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CAACCCTAAAAGAAGTCAACA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.462 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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