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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2026-03-06 16:03:50, GGGenome : DDBJ release 139.0 (Sep, 2025)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Cannabis sativa cultivar ERBxHO40_23 chromosome 5.
CP158644.1:6348596-6348615
GCTGTTCTTGTTGTGGATATTGAACATTGC6348596TTAACCGGCTTGGCTTATACGTAGCGTTATCAAAGCCAGAGACTTGGTTT
Carlina vulgaris genome assembly, chromosome: 3.
OZ238174.1:257318012-257318031
ACACACACACCGGTTAAGACTCTTACAACC257318012TTAACCGGCTTGGCTTATACACCAGTTAACAACTAGCATACCCATAACCA
TSA: Cannabis sativa PK00025.1_1.CasaPuKu mRNA sequence.
JP449594.1:329-348
AAACCAAGTCTCTGGCTTTGATAACGCTAC329GTATAAGCCAAGCCGGTTAAGCAATGTTCAATATCCACAACAAGAACAGC
Cannabis sativa cultivar ERBxHO40_23 chromosome 5.
CP158654.1:72024132-72024151
AAACCAAGTCTCTGGCTTTGATAACACTAC72024132GTATAAGCCAAGCCGGTTAAGCAATGTTCAATATCCACAACAAGAACAGC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TTAACCGGCTTGGCTTATAC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TTAACCGGCTTGGCTTATAC | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.490 | 0.481 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50900/match?q=TTAACCGGCTTGGCTTATAC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.748 | 0.258 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50900/match?q=GTATAAGCCAAGCCGGTTAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.750 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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