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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-01-10 02:37:28, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Prunus dulcis DNA, pseudomolecule Pd06.
AP019302.1:23434294-23434317
TTAATTATGCACTAAGTCAGGGGGACATAA23434294TTAACTTGTCTCAAACAAACAAACTCCATAAACAAAAAGGTTAATTATGAGATA
Yponomeuta malinellus genome assembly, chromosome: 1.
OX370994.1:17425347-17425370
ATGATTGGTTCGTACATTATTTGTGAGTTT17425347GTTTGTTTGTTTGAGACAAGTTAAGATCATAGGAAAATTTACTATAAAATGGAT
Yponomeuta cagnagella genome assembly, chromosome: 1.
OX371267.1:17827870-17827893
ATGATTGGTTCGTACATTATTTGTGAGTTT17827870GTTTGTTTGTTTGAGACAAGTTAAGATCATAGGAAAATTTACTATAAAATGGAT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TTAACTTGTCTCAAACAAACAAAC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TTAACTTGTCTCAAACAAACAAAC | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.376 | 0.367 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TTAACTTGTCTCAAACAAACAAAC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.476 | 0.101 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GTTTGTTTGTTTGAGACAAGTTAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.477 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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