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データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
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2025-04-12 07:38:12, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Dolomedes plantarius genome assembly, chromosome: 2.
OU015491.1:175135800-175135819
AAAATGATTTCTGTTGTGCAGTCGCCATCT175135800TTACGAACACCCCCTTTCTGCCTATACATTATTCAATCAGAACGGATTAA
Arachis hypogaea DNA, clone: AHGS49G01.
DH961620.1:575-594
TGGTGACTGTGTTTAGGGTTAGGTTGCTAA575CAGAAAGGGGGTGTTCGTAAATTTTGTTCTTCTCTCTCTAATTGTTATAA
Arachis hypogaea cultivar Shitouqi chromosome A03.
CP030985.1:24237917-24237936
TGGTGACTGTGTTTAGGGTTAGGTTGCTAA24237917CAGAAAGGGGGTGTTCGTAAATTTTGTTCTTCTCTCTCTAATTGTTATAA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TTACGAACACCCCCTTTCTG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TTACGAACACCCCCTTTCTG | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.388 | 0.379 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TTACGAACACCCCCTTTCTG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.490 | 0.101 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CAGAAAGGGGGTGTTCGTAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.491 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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