GGGenome Help | English

データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-04-03 11:36:36, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Arachis hypogaea DNA, clone: NYHA00A27, cultivar: Nakateyutaka.
DE998916.1:574-597
TATAGGTGGAAGAAATATAATTTAATACAG574GTGACCTTACATGAATTGGTCTAATAATTTATTAATATATTAAAAATTAATTAA
Arachis hypogaea cultivar Shitouqi chromosome B01.
CP030993.1:10910742-10910765
TATAGGTGGAAGAAATATAATTTAATACAG10910742GTGACCTTACATGAATTGGTCTAATAATTTATTAATATATTAAAAATTAATTAA
Arachis ipaensis cultivar K30076 chromosome 01.
CP049892.1:10993382-10993405
TATAGGTGGAAGAAATATAATTTAATACAG10993382GTGACCTTACATGAATTGGTCTAATAATTTATTAATATATTAAAAATTAATTAA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TTAGACCAATTCATGTAAGGTCAC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TTAGACCAATTCATGTAAGGTCAC | format : html | download : | debug :

0.008 | 0.008 | search_start;
0.163 | 0.155 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TTAGACCAATTCATGTAAGGTCAC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.287 | 0.124 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GTGACCTTACATGAATTGGTCTAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.290 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).