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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
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2025-03-24 17:39:35, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Vigna angularis mRNA, clone: VES06D07.
HX944420.1:451-470
TTGGGTCTCGGTCAAGCCATGGTGGACTTC451TCTGGCATGGTCGATGATAATTTTCTGAAGAATTTGGGGTTAGAGAAGGG
Vigna angularis mRNA, clone: VES07M24.
HX945031.1:451-470
TTGGGTCTCGGTCAAGCCATGGTGGACTTC451TCTGGCATGGTCGATGATAATTTTCTGAAGAATTTGGGGTTAGAGAAGGG
Vigna angularis var. angularis DNA, chromosome 6, almost complete sequence, cultivar: Shumari.
AP015039.1:37593441-37593460
TTTTGTTGGAAATTCTTGTAGGTGGACTTC37593441TCTGGCATGGTCGATGATAATTTTCTGAAGAATTTGGGGTTAGAGAAGGG
Rhorus exstirpatorius genome assembly, chromosome: 2.
OY751314.1:45860143-45860162
ACCAATTACAAGTCTACTAGATAACAAATC45860143TCTGGCATGGTCGATGATAATTACCGGTAGCTTACTGGAATAACAACACA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TTATCATCGACCATGCCAGA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TTATCATCGACCATGCCAGA | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.352 | 0.343 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TTATCATCGACCATGCCAGA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.609 | 0.257 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TCTGGCATGGTCGATGATAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.612 | 0.003 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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