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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 19:22:24, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Thereva unica genome assembly, chromosome: 2.
OX465282.1:146053983-146054002
GTTATGCTACATGTTATTCCCCCTCCCCAA146053983TTCCGCTGACAACTGACCACCAGTGACTATTATTTTTTTTTTAAAACTCA
Capsicum annuum Takanotsume DNA, chromosome 10, sequence.
AP026705.1:232423213-232423232
CAGTTCAACCTCAGATGAAAGAATAGAATT232423213GTGGTCAGTTGTCAGCGGAAAAGTAGTCAAATTTTGAGAACCGTTTGGAC
Capsicum annuum cultivar G1-36576 isolate CaT2T chromosome 10.
CP124722.1:237018673-237018692
CAGTTCAACCTCAGATGAAAGAATAGAATT237018673GTGGTCAGTTGTCAGCGGAAAAGTAGTCAAATTTTGAGAACCGTTTGGAC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TTCCGCTGACAACTGACCAC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TTCCGCTGACAACTGACCAC | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.316 | 0.307 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TTCCGCTGACAACTGACCAC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.400 | 0.084 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GTGGTCAGTTGTCAGCGGAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.401 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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