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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 14:31:28, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Martes martes genome assembly, chromosome: X.
OY734072.1:52557548-52557568
GAAATCTTAAGTTAACTCCCTTGAAAATAT52557548TTCCTATCAAACCATTCCATAGCAGCCTTGGCAGTTGGTGGGTTTTCATAA
SDSS2_65 SDSS2 Camellia sinensis var. sinensis cDNA clone P65 5', mRNA sequence.
GH710894.1:55-75
CGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGACCT55TTCCTATCAAACCATTCCATACAATTCCATGGAGGATTCCACCACCACCAC
Tea010_2005-10-30_1/Tea010_C05_022_1 Camellia sinensis (tea) cultivar DT1 EST library Camellia sinensis cDNA, mRNA sequence.
JK478934.1:9-29
GGGGACCT9TTCCTATCAAACCATTCCATACAATTCCATGGAGGATTCCACCACCACCAC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TTCCTATCAAACCATTCCATA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TTCCTATCAAACCATTCCATA | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.465 | 0.456 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TTCCTATCAAACCATTCCATA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.558 | 0.093 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TATGGAATGGTTTGATAGGAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=47
0.558 | 0.000 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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