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データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
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2025-04-03 13:19:07, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Dianthus caryophyllus mRNA, clone: CES09O08, 5' end sequence.
FY385842.1:17-39
GCTTAATTCTACTATT17TTCCTTTGAACTTTTCCTCACAAAAAATAAAATGGCTTCTAATAACCACAACA
Dianthus caryophyllus mRNA, clone: CES31G16, 5' end sequence.
FY393945.1:4-26
GTT4TTCCTTTGAACTTTTCCTCACAAAAAATAAAATGGCTTCTAATAACCACAACA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TTCCTTTGAACTTTTCCTCACAA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TTCCTTTGAACTTTTCCTCACAA | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.331 | 0.322 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TTCCTTTGAACTTTTCCTCACAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.424 | 0.093 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TTGTGAGGAAAAGTTCAAAGGAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.424 | 0.000 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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