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データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-04-03 16:10:14, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

TSA: Cannabis sativa PK01447.1_1.CasaPuKu mRNA sequence.
JP449434.1:1863-1882
GGATTGATCCATCACTGGCCATTGAACGAG1863TTCGAAGCAGGTCTCTCTCTAAGAGAGGTAGGAAGAGGGAGAGGTCAGTT
Humulus lupulus genome assembly, chromosome: 1.
OY720647.1:5335264-5335283
AACAGACCTCTCCCTTTTCCTACCTCTCTT5335264AGAGAGAGACCTGCTTCGAACTCGGTTAATTGCCAGTGATGGATCAAGCC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TTCGAAGCAGGTCTCTCTCT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TTCGAAGCAGGTCTCTCTCT | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.230 | 0.222 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TTCGAAGCAGGTCTCTCTCT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.317 | 0.087 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AGAGAGAGACCTGCTTCGAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.318 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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