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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-10 18:27:53, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Daucus carota isolate Kuroda chromosome 2.
CP125302.1:2323732-2323751
AAATTCCGCTGTTATGACGAAATATGTGAG2323732TTCGAAGGACAATCTGAGGATTCTGATGAACCTGCTCAGAGTATGATCTC
Daucus carota subsp. sativus cultivar DH1 chromosome 2.
CP093344.1:11968272-11968291
TACTCTGAGCAGGTTCATCAGAATCCTCAA11968272TCCTCAGATTGTCCTTCGAACTCACATATTTCGTCATAACAGCGGAATTT
Daucus carota subsp. sativus cultivar DH1 chromosome 2.
CP093344.1:11987744-11987763
GAGATCATACCCTGAGCAGGTTCATCAGAA11987744TCCTCAGATTGTCCTTCGAACTCACATATTTCGTCATAACAGCGGAATTT
Daucus carota isolate Kuroda chromosome 2.
CP125302.1:2338957-2338976
GAGATCATACCCTGAGCAGGTTCATCAGAA2338957TCCTCAGATTGTCCTTCGAACTCACATATTTCGTCATAACAGCGGAATTT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TTCGAAGGACAATCTGAGGA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TTCGAAGGACAATCTGAGGA | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.369 | 0.360 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TTCGAAGGACAATCTGAGGA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.465 | 0.096 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TCCTCAGATTGTCCTTCGAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.467 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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