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2025-04-08 19:12:33, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Lotus japonicus genomic DNA, chromosome 6, clone: LjT30M07, TM0331a.
AP006650.1:27848-27867
TCCTTTATCTTTCTTACATGGTATCCTGAG27848TTCGTGAGATCAATTATGGCTATTTCTTACAGGAATTTGTAAAAATTTAT
Lotus japonicus B-129 DNA, chromosome 6, complete sequence.
AP022634.1:46316273-46316292
TCCTTTATCTTTCTTACATGGTATCCTGAG46316273TTCGTGAGATCAATTATGGCTATTTCTTACAGGAATTTGTAAAAATTTAT
Sorghum bicolor clone BAC 796all, complete sequence.
AY661658.1:81054-81073
GGGTTCCCTGAATTTTTGCATGGTAGTGTC81054GCCATAATTGATCTCACGAATATGCAGTGTAACACTCTTTGTTTCTTGTC
Sorghum bicolor clone BAC 75D9, complete sequence.
AY661659.1:1769-1788
GGGTTCCCTGAATTTTTGCATGGTAGTGTC1769GCCATAATTGATCTCACGAATATGCAGTGTAACACTCTTTGTTTCTTGTC
Sorghum bicolor cultivar Hongyingzi chromosome 8.
CP137832.1:61070375-61070394
GGGTTCCCTGAATTTTTGCATGGTAGTGTC61070375GCCATAATTGATCTCACGAATATGCAGTGTAACACTCTTTGTTTCTTGTC
Sorghum bicolor cultivar Huandiaonuo chromosome 8.
CP137842.1:60959238-60959257
GGGTTCCCTGAATTTTTGCATGGTAGTGTC60959238GCCATAATTGATCTCACGAATATGCAGTGTAACACTCTTTGTTTCTTGTC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TTCGTGAGATCAATTATGGC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TTCGTGAGATCAATTATGGC | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.324 | 0.315 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TTCGTGAGATCAATTATGGC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.426 | 0.102 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GCCATAATTGATCTCACGAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.429 | 0.003 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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