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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2026-03-05 09:17:40, GGGenome : DDBJ release 139.0 (Sep, 2025)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

GR__Eb015D18.r GR__Eb Gossypium raimondii cDNA clone GR__Eb015D18 3', mRNA sequence.
CO114211.1:60-79
TCAACAACAGCAGCAGCAGCAACAAGCTAT60TTCTAGGGTCCCTTCAAACATAGATGCCCATTTACGTACTACTCCTGGTG
Avena fatua genome assembly, chromosome: 2A.
OX371392.1:463043253-463043272
TTCCGAACAGCCTTGGAAGCATGAAAAACC463043253TTCTAGGGTCCCTTCAAACATTGGACCTCTCACACTGCAATAAACTAGTG
Avena barbata genome assembly, chromosome: 7B.
OX371327.1:527281534-527281553
CACTAGTTTATTGCAGTGTGAGAAGTCCAA527281534TGTTTGAAGGGACCCTAGAAGGTTTTTCAGACTTCCAAGGCTGTTCGGAA
Avena sterilis genome assembly, chromosome: 2A.
OX371839.1:480153728-480153747
CACTAGTTTATTGCAGTGTGAGAGGTCCAA480153728TGTTTGAAGGGACCCTAGAAGGTTTTTCATGCTTCCAAGGCTGTTCGGAA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TTCTAGGGTCCCTTCAAACA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TTCTAGGGTCCCTTCAAACA | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.497 | 0.487 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50900/match?q=TTCTAGGGTCCCTTCAAACA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.880 | 0.383 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50900/match?q=TGTTTGAAGGGACCCTAGAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.881 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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