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データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-04-03 12:41:26, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

AFP0ABA27YE09RM1 BAC end, cultivar HD200-94 of Coffea canephora, genomic survey sequence.
FO612128.1:502-529
AGGGCCTTGACCAAGACAACTTGTCTTGCC502TTCTTATCACCTTGGGCTACCTTTCTTCCTCATTTTTTCTGCTGTTTGGCCGAGAGAG
Coffea canephora microsatellite CCRM06 sequence.
KM874370.1:204-231
AGGGCCTTGACCAAGACAACTTGTCTTGCC204TTCTTATCACCTTGGGCTACCTTTCTTCCTCTTTTTTTCTGCTGTTTGCCTAAGAGAG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TTCTTATCACCTTGGGCTACCTTTCTTC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TTCTTATCACCTTGGGCTACCTTTCTTC | format : html | download : | debug :

0.008 | 0.008 | search_start;
0.244 | 0.235 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TTCTTATCACCTTGGGCTACCTTTCTTC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.339 | 0.096 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GAAGAAAGGTAGCCCAAGGTGATAAGAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.339 | 0.000 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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