GGGenome Help | English

データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-04-03 16:13:32, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Elaeis guineensis EST, clone (6lib)_isotig47241.
LM643476.1:247-270
GGCTACATGCCACACCGACACGGCCGGATA247CAATCCCGAGCATGTGGCTTTCAAGCTGCTCCACGTCAAGCCCGGGACGGTGCC
TSA: Elaeis guineensis contig09239.Elguifruit mRNA sequence.
JO087218.1:840-863
GGCTACATGCCACACCGACACGGCCGGATA840CAATCCCGAGCATGTGGCTTTCAAGCTGCTCCACGTCAAGCCCGGGACGGTGCC
Elaeis guineensis dehydration-responsive protein RD22-like isoform 2 (RD22) mRNA, complete cds.
KC146056.1:828-851
GGCTACATGCCACACCGACACGGCCGGATA828CAATCCCGAGCATGTGGCTTTCAAGCTGCTCCACGTCAAGCCCGGGACGGTGCC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TTGAAAGCCACATGCTCGGGATTG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TTGAAAGCCACATGCTCGGGATTG | format : html | download : | debug :

0.008 | 0.008 | search_start;
0.201 | 0.192 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TTGAAAGCCACATGCTCGGGATTG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.394 | 0.194 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CAATCCCGAGCATGTGGCTTTCAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.397 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).