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データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-04-08 04:59:07, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Lotus japonicus genomic DNA, chromosome 5, clone: LjT18P14, TM0186.
AP009954.1:78781-78801
AACAACAACAACAAGGGTCAGGGTCATTAT78781GTCAGTGTTGGTTCATATCAAAAACTGGATCAGGATTACGATTTCCGAGAC
Lotus japonicus B-129 DNA, chromosome 5, complete sequence.
AP022633.1:50999924-50999944
TTCAACAACAACAAGGGTCAGGGTCATTAT50999924GTCAGTGTTGGTTCATATCAAAAACTGGATCAGGATTACGATTTCCGAGAC
Xylocampa areola genome assembly, chromosome: 12.
OW285211.1:12905863-12905883
TTTCCCGAAAAGTTACTCGGTTGCCAAACA12905863GTCAGTGTTGGTTCATATCAAGTCGAGATCTAAACCAACCATCCATAAAGT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TTGATATGAACCAACACTGAC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TTGATATGAACCAACACTGAC | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.323 | 0.314 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TTGATATGAACCAACACTGAC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.442 | 0.119 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GTCAGTGTTGGTTCATATCAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.444 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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