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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 14:41:49, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

TSA: Elaeis guineensis isotig11295.Elguifruit mRNA sequence.
JO098522.1:244-270
TCATCGAAGACTGTTCCATCCTTAATTCCT244TTGATCCTTCGATCCATCTGGAGCTAATCTACTACTCGATTTTCGTGATGCCGATCC
OPR03821 Elaeis guineensis root Elaeis guineensis cDNA clone OPVRXX_A3248.seq, mRNA sequence.
EL693763.1:159-185
CGGATCGGATCACCAAAATCGAGTAGTAGA159TTAGCTCCAGATGGATCGAAGGATCAAAGGAATTAAGGATGGAACAGTCTTCGATGA
Elaeis guineensis EST, clone (6lib)_isotig11125.
LM620316.1:1256-1282
GGATCGGCATCACCAAAATCGAGTAGTAGA1256TTAGCTCCAGATGGATCGAAGGATCAAAGGAATTAAGGATGGAACAGTCTTCGATGA
Elaeis guineensis clone estEgSNP18 sucrose responsive element-binding protein (SREBP) mRNA, complete cds.
JX438713.1:1217-1243
GGATCGGCATCACGAAAATCGAGTAGTAGA1217TTAGCTCCAGATGGATCGAAGGATCAAAGGAATTAAGGATGGAACAGTCTTCGATGA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TTGATCCTTCGATCCATCTGGAGCTAA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TTGATCCTTCGATCCATCTGGAGCTAA | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.314 | 0.305 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TTGATCCTTCGATCCATCTGGAGCTAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.542 | 0.228 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TTAGCTCCAGATGGATCGAAGGATCAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.544 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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