GGGenome Help | English

データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-11 23:38:12, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Arachis hypogaea DNA, clone: SAAC10P12.
DH966563.1:743-762
GGCTCACAGTGATGACGACTGGCAAAGACG743TTGCAACGACGAGTCTATCGTAGAGCGCGCGCACACACACACACACACAC
IPAHM0586 Microsatellite enriched genomic DNA library of groundnut Arachis hypogaea genomic clone IPAHM0586, genomic survey sequence.
ER974565.1:310-329
GGCTCACAGTGATGACGACTGGCAAAGACG310TTGCAACGACGAGTCTATCGTAGAGCGCGCGCACACACACACACACACAC
Arachis hypogaea DNA, clone: AHGS47F03.
DH961690.1:321-340
GTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGCGCGCTCTA321CGATAGACTCGTCGTTGCAACGTCTTTGCCAGTCGTCATCACTGTGAGCC
Arachis hypogaea cultivar Shitouqi chromosome B04.
CP030996.1:25647762-25647781
GTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGCGCGCTCTA25647762CGATAGACTCGTCGTTGCAACGTCTTTGCCAGTCGTCATCACTGTGAGCC
Arachis ipaensis cultivar K30076 chromosome 04.
CP049895.1:24812739-24812758
GTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGCGCGCTCTA24812739CGATAGACTCGTCGTTGCAACGTCTTTGCCAGTCGTCATCACTGTGAGCC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TTGCAACGACGAGTCTATCG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TTGCAACGACGAGTCTATCG | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.170 | 0.161 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TTGCAACGACGAGTCTATCG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.243 | 0.073 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CGATAGACTCGTCGTTGCAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.245 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).