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データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2026-02-22 21:06:40, GGGenome : DDBJ release 138.0 (Jun, 2025)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Melinopterus prodromus genome assembly, chromosome: 4.
OZ030393.1:14112545-14112565
AAATATTTGTTTACCTGATTGGTACGCAAA14112545TTGCGCAAATTTACGGACTACCAGTTATGCCAGGTACAGTCAATAGTGACA
Mdfr3026g04.y1 Mdfr Malus domestica cDNA clone Mdfr3026g04 5' similar to SW:BGAL_MALDO P48981 BETA-GALACTOSIDASE PRECURSOR, mRNA sequence.
CO753557.1:468-488
CTGATATACGTAGGATTACATACAAAGTTT468GTAGTCCGTAAATTTGCGCAAGCATTTCCAATTGTAAGTTTGTAAC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TTGCGCAAATTTACGGACTAC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TTGCGCAAATTTACGGACTAC | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.111 | 0.103 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50800/match?q=TTGCGCAAATTTACGGACTAC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.173 | 0.062 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50800/match?q=GTAGTCCGTAAATTTGCGCAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.174 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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