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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 12:46:12, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

pOP-SFB00072 SFB (Oil Palm Inflorescence) Elaeis guineensis cDNA clone pOP-SFB00072 5', mRNA sequence.
JK629486.1:510-533
GGCGAATGAACACGATCGCTAGTGCTATAG510TTGGTCATTGGAGGCTCCTTCCTTGGCGGCGGTGACTGCCTATGCACTAGGCTG
Elaeis guineensis EST, clone (6lib)_isotig09540.
LM612421.1:607-630
GGCGAATGAACACGATCGCTAGTGCTATAG607TTGGTCATTGGAGGCTCCTTCCTTGGCGGCGGTGACTGCCTATGCACTAGGCTG
TSA: Elaeis guineensis isotig13854.Elguifruit mRNA sequence.
JO101081.1:2545-2568
CAGCCTAGTGCATAGGCAGTCACCGCCGCC2545AAGGAAGGAGCCTCCAATGACCAACTATAGCACTAGCGATCGTGTTCATTCGCC
Elaeis guineensis dead-box ATP-dependent RNA helicase (DDX) mRNA, partial cds.
KC146065.1:688-711
CAGCCTAGTGCATAGGCAGTCACCGCCGCC688AAGGAAGGAGCCTCCAATGACCAACTATAGCACTAGCGATCGTGTTCATTCGCC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TTGGTCATTGGAGGCTCCTTCCTT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TTGGTCATTGGAGGCTCCTTCCTT | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.326 | 0.317 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TTGGTCATTGGAGGCTCCTTCCTT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.419 | 0.093 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AAGGAAGGAGCCTCCAATGACCAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.420 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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