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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
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2025-04-03 11:27:00, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Arachis hypogaea cultivar Shitouqi chromosome B04.
CP030996.1:76958114-76958133
GACCCTCTGTTGCAAGATGTGACCGGGTAC76958114TTTAACTCCCCATGTTCCCCATGGGCATATATATACACACACACACACAC
Arachis ipaensis cultivar K30076 chromosome 04.
CP049895.1:96249551-96249570
GACCCTCTGTTGCAAGATGTGACCGGGTAC96249551TTTAACTCCCCATGTTCCCCATGGGCATATATATACACACACACACACAC
Sambucus nigra genome assembly, chromosome: 3.
OX422209.1:134078808-134078827
AAAATTAAATTTTTGGCAGTTTTATTTTTT134078808TTTAACTCCCCATGTTCCCCATATTCCCACTATCTTTTATCAGACATAAT
Pemphredon lugubris genome assembly, chromosome: 3.
OW121817.1:20725928-20725947
CCCGTCGCAGATTAGTTGGGAAAATCGTAG20725928TTTAACTCCCCATGTTCCCCGCAATCATAGCTTCACGCGATAATGGACTA
Arachis hypogaea DNA, clone: AHGS40N18.
DH961631.1:322-341
GTGTGTGTGTGTGTGTATATATATGCCCAT322GGGGAACATGGGGAGTTAAAGT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TTTAACTCCCCATGTTCCCC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TTTAACTCCCCATGTTCCCC | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.181 | 0.172 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TTTAACTCCCCATGTTCCCC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.294 | 0.113 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GGGGAACATGGGGAGTTAAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=46
0.295 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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