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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 15:11:49, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Lotus japonicus B-129 DNA, chromosome 1, complete sequence.
AP022629.1:105159219-105159238
GTGCTTGCTAGCTTTAGCTAGTTATGTTAT105159219TTTACTCATGTTGAGAGGGGTTGTTTCTCAACATTTTATATATATATATA
Lotus japonicus B-129 DNA, chromosome 2, complete sequence.
AP022630.1:53727384-53727403
TTTTGGTCGACTTTCTGTTGACTTGATTAG53727384TTTACTCATGTTGAGAGGGGTTGTTTCTCAACATTATATATGGTTTTCGA
Felis catus Senzu DNA, chromosome: E1, American Shorthair breed.
AP023165.1:60950675-60950694
CTCTCTCCCTCTCCGCCCCCATCCCTCCCT60950675CCCCTCTCAACATGAGTAAATAAACTTAACAAAACAATACAAAACGAAAC
Lotus japonicus genomic DNA, chromosome 1, clone: LjB10L14, BM1697.
AP009628.1:16746-16765
TATATATATATATAAAATGTTGAGAAACAA16746CCCCTCTCAACATGAGTAAAATAACATAACTAGCTAAAGCTAGCAAGCAC
Lotus japonicus B-129 DNA, chromosome 1, complete sequence.
AP022629.1:104942291-104942310
TATATATATATATAAAATGTTGAAAAACAA104942291CCCCTCTCAACATGAGTAAAATAACCTAACTAGCTAAAGCTAGCAAGCAC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TTTACTCATGTTGAGAGGGG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TTTACTCATGTTGAGAGGGG | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.192 | 0.183 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TTTACTCATGTTGAGAGGGG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.289 | 0.097 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CCCCTCTCAACATGAGTAAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.291 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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