GGGenome Help | English

データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-04-03 16:09:02, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Micropterix aruncella genome assembly, chromosome: 10.
OX155959.1:15059744-15059763
AACATGATAAGATAGTGCGCCGTCTGAAAA15059744TTTAGTCGACACGTTAGCAAGCGAGTTGAGCTGTTCGTCAATTTTCCAGA
Pyrus communis genome assembly, chromosome: 2.
OY757069.1:5353131-5353150
GGATCAAACCGGTAAGCCTTACTCAAAATA5353131TTGCTAACGTGTCGACTAAATGATATGAGTATTTCTGCGCCTGCTTTGCT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TTTAGTCGACACGTTAGCAA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TTTAGTCGACACGTTAGCAA | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.316 | 0.307 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TTTAGTCGACACGTTAGCAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.406 | 0.090 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TTGCTAACGTGTCGACTAAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.407 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).