GGGenome Help | English

データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 11:40:03, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Lotus japonicus B-129 DNA, chromosome 3, complete sequence.
AP022631.1:10548397-10548416
AGTGGAGGAAGAATTCTTCATTAAATATCC10548397TTTCATCAGTATCCAACCCGCCCCATACCCGCACACATATATTATTATTA
Azorinus chamasolen genome assembly, chromosome: 10.
OY755244.1:43943937-43943956
GATCCAGATGAGACGCAGAGTAATCAAGAG43943937TTTCATCAGTATCCAACCCGTCTGTTACCCTCGTTAAATACAGTCTTTCA
Lotus japonicus genomic DNA, chromosome 3, clone: LjB15I15, BM0531.
AP006836.1:8345-8364
TAATAATAATATATGTGTGCGGGTATGGGG8345CGGGTTGGATACTGATGAAAGGATATTTAATGAAGAATTCTTCCTCCACT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TTTCATCAGTATCCAACCCG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TTTCATCAGTATCCAACCCG | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.149 | 0.140 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TTTCATCAGTATCCAACCCG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.234 | 0.085 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CGGGTTGGATACTGATGAAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.235 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).