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データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-04-03 15:06:51, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Daucus carota subsp. sativus cultivar DH1 chromosome 1.
CP093343.1:37459327-37459349
ATCTCGGGCAGATTATAGACAAGCACAGAA37459327CTCAGAACTGTTGACAGAGCAAATATCCTGCAATGCCAAACCAAAAGAAAGTA
Daucus carota isolate Kuroda chromosome 1.
CP125301.1:38675232-38675254
ATCTCGGGCAGATTATAGACAAGCACAGAA38675232CTCAGAACTGTTGACAGAGCAAATATCCTGCAATGCCAAACCAAAAGAAAGTA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TTTGCTCTGTCAACAGTTCTGAG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TTTGCTCTGTCAACAGTTCTGAG | format : html | download : | debug :

0.008 | 0.008 | search_start;
0.219 | 0.211 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TTTGCTCTGTCAACAGTTCTGAG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.309 | 0.090 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CTCAGAACTGTTGACAGAGCAAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.311 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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