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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-08 19:03:11, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Peromyscus eremicus genome assembly, chromosome: 9.
OX460403.1:77586557-77586576
TCTGTCTTCATTTCATATACATTATTCCCT77586557TTTGTTCCTCCACCCCAAGCTTTAAACCTCTTCCTCGGGCTTGGAAGCTC
Peromyscus eremicus genome assembly, chromosome: 9.
OX460475.1:77032415-77032434
TCTGTCTTCATTTCATATACATTATTCCCT77032415TTTGTTCCTCCACCCCAAGCTTTAAACCTCTTCCTTGGGCTTGGAAGCTC
KN-1127-B-69_I23_SP6 Platynereis dumerilii mixed stages library Platynereis dumerilii cDNA clone KN-1127-B-69_I23 5', mRNA sequence.
JZ444521.1:638-657
ATGGTCAACAAGAATCCTTCTCAAGAATTC638TTTGTTCCTCCACCCCAAGCCGTTGCACACACCCTCATCAGAGCATGGTT
Lotus japonicus genomic DNA, chromosome 5, clone: LjT29A12, TM0657.
AP010500.1:15078-15097
CAAAGAGACAATAGATAGCCAAGAGGGAAT15078TTTGTTCCTCCACCCCAAGCAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG
Lotus japonicus B-129 DNA, chromosome 5, complete sequence.
AP022633.1:16696756-16696775
CAAAGAGACAATAGATAGCCAAGAGGGAAT16696756TTTGTTCCTCCACCCCAAGCAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TTTGTTCCTCCACCCCAAGC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TTTGTTCCTCCACCCCAAGC | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.200 | 0.191 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TTTGTTCCTCCACCCCAAGC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.230 | 0.030 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GCTTGGGGTGGAGGAACAAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=45
0.230 | 0.000 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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