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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 16:10:13, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Avena sativa genome assembly, chromosome: 1C.
OU342385.1:169147264-169147283
ATACACTTATACAGCAACAACAAGCAAGCC169147264TTTTATCCCGAGCAAGTTGGGGTAGGCTAGATATGCAACCCAAACAGAAA
Avena sativa genome assembly, chromosome: 8.
OV702286.1:189377392-189377411
ATACACTTATACAGCAACAACAAGCAAGCC189377392TTTTATCCCGAGCAAGTTGGGGTAGGCTAGATATGCAACCCAAACAGAAA
Avena insularis genome assembly, chromosome: 1C.
OU342338.1:131026362-131026381
TTTCTGTTTGGGTTGCATATCTAGCCTACC131026362CCAACTTGCTCGGGATAAAAGGCTTGCTTGTTGTTGCTGTATACGTGTAT
Avena eriantha genome assembly, chromosome: 1C.
OU342740.1:161449164-161449183
TTTCTGTTTGGGTTGCATATCTAGCCTACC161449164CCAACTTGCTCGGGATAAAAGGCTTGCTTGTTGTTGCTGTATACGTGTAT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TTTTATCCCGAGCAAGTTGG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TTTTATCCCGAGCAAGTTGG | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.149 | 0.140 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TTTTATCCCGAGCAAGTTGG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.230 | 0.081 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CCAACTTGCTCGGGATAAAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.231 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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