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データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-04-03 20:02:28, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Contig0795.SEQ Pigeonpea genomic pBluescript and pGEM-T library Cajanus cajan genomic 5', genomic survey sequence.
DU169871.1:106-127
AATATGTAAGTGTGAAACATTGTATTCTAT106AAGCTACAAGGGATACACATGCATATACACATGCAATTAATGCATGAATTTA
50-L026565.SEQ Pigeonpea genomic pGEM-T library Cajanus cajan genomic 3', genomic survey sequence.
CZ682014.1:759-780
TAAATTCATGCATTAATTGCATGTGTATAT759GCATGTGTATCCCTTGTAGCTTATAGAATACAATGTTTCACACTTACATATT
96-L025670.SEQ Pigeonpea genomic pGEM-T library Cajanus cajan genomic 5', genomic survey sequence.
DU169862.1:373-394
TAAATTCATGCATTAATTGCATGTGTATAT373GCATGTGTATCCCTTGTAGCTTATAGAATACAATGTTTCACACTTACATATT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/aagctacaagggatacacatgc
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : aagctacaagggatacacatgc | format : html | download : | debug :

0.008 | 0.008 | search_start;
0.143 | 0.134 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AAGCTACAAGGGATACACATGC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.207 | 0.064 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GCATGTGTATCCCTTGTAGCTT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.208 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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