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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-09 19:36:29, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Ipomoea triloba cultivar NCNSP0323 chromosome 4.
CP025663.1:27468129-27468152
ACCAACAAACACCTTAGTGTATGTGGTGTC27468129ACCGAACTGCCCACTCATGTTATTATTGCTGCTGCTGTTGTTAGATACTGCTGC
Ipomoea nil mRNA, clone: JMFS004C08, 5' end sequence, expressed in flower and flower bud, cultivar: Tokyo-kokei standard.
HY936193.1:329-352
GCAGCATCTAATAACAAGAGCAGCAGCAAC329AATAACATGAGTGGGCAGTTCGGTGACACCACATACACTAAGGTGTTTGTTGGT
Ipomoea nil mRNA, clone: JMFS065F12, 5' end sequence, expressed in flower and flower bud, cultivar: Tokyo-kokei standard.
HY941006.1:328-351
GCAGCATCTAATAACAAGAGCAGCAGCAAC328AATAACATGAGTGGGCAGTTCGGTGACACCACATACACTAAGGTGTTTGTTGGT
Ipomoea nil mRNA, clone: JMFS067F10, 5' end sequence, expressed in flower and flower bud, cultivar: Tokyo-kokei standard.
HY941178.1:337-360
GCAGCATCTAATAACAAGAGCAGCAGCAAC337AATAACATGAGTGGGCAGTTCGGTGACACCACATACACTAAGGTGTTTGTTGGT
Ipomoea nil mRNA, clone: JMFS132C08, 5' end sequence, expressed in flower and flower bud, cultivar: Tokyo-kokei standard.
HY946127.1:387-410
GCAGCATCTAATAACAAGAGCAGCAGCAAC387AATAACATGAGTGGGCAGTTCGGTGACACCACATACACTAAGGTGTTTGTTGGT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/accgaactgcccactcatgttatt
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : accgaactgcccactcatgttatt | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.393 | 0.384 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ACCGAACTGCCCACTCATGTTATT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.949 | 0.556 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AATAACATGAGTGGGCAGTTCGGT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.952 | 0.003 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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