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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-04-03 15:53:26, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Ipomoea nil cDNA clone:jmsf11p21, 5' end.
CJ737707.1:6-29
GGCAG6ACGGCCTGACAGCCAGATAAATAATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTAAA
Ipomoea nil cDNA clone:jmsf30m17, 5' end.
CJ745098.1:4-27
AAG4ACGGCCTGACAGCCAGATAAATAATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTAAA
Ipomoea trifida cultivar NCNSP0306 chromosome 2.
CP025645.1:8533536-8533559
GAGAGAGAGATTGAAAAGCAAAGGGAGAGA8533536TTATTTATCTGGCTGTCAGGCCGTCTACATGTAATATGCATTTATCAACCGTAT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/acggcctgacagccagataaataa
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : acggcctgacagccagataaataa | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.235 | 0.226 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ACGGCCTGACAGCCAGATAAATAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.310 | 0.075 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TTATTTATCTGGCTGTCAGGCCGT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.311 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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