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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 15:41:37, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Ipomoea trifida cultivar NCNSP0306 chromosome 9.
CP025652.1:6074148-6074171
AAGGACATGGGAGGAGATAAGTGCTTTCTT6074148AGAGCGGCAAATACCACAGAACTCGCAGTAATACCTCCTTATGTCCTTGAAAAT
Ipomoea triloba cultivar NCNSP0323 chromosome 9.
CP025668.1:7329456-7329479
AAGGACATGGGAGGAGATGAGTGCTTTCTT7329456AGAGCGGCAAATACCACAGAACTCGCAGTAATATCTCCTTATGTCCTTGAAAAT
Ipomoea nil cDNA clone:jmsf20l17, 5' end.
CJ741115.1:179-202
TTTTTCANGGACATANNGAGATATTACTGC179GAGTTCTGTGGTATTTGCCGCTCTAANAAAGCACTCNTCTCCTCCCNTGTCCTT
Ipomoea nil cDNA clone:jmsf24c04, 5' end.
CJ742353.1:178-201
NTTTTCANGGACATANNGAGATATTACTGC178GAGTTCTGTGGTATTTGCCGCTCTAANAAAGCACTCNTCTCCTCCCNTGTCCTT
Ipomoea nil cDNA clone:jmsf4o24, 5' end.
CJ750503.1:181-204
TTTTTCNNGGACATANNGAGATATTACTGC181GAGTTCTGTGGTATTTGCCGCTCTAAGAAAGCACTCATCTCCTCCCNTGTCCTT
TSA: Ipomoea batatas Contig_15899.Ipbalsr mRNA sequence.
JP120487.1:119-142
ATTTTCAAGGACATAAGGAGGTATTACTGC119GAGTTCTGTGGTATTTGCCGCTCTAAGAAAGCACTTATCTCCTCCCATGTCCTT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/agagcggcaaataccacagaactc
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : agagcggcaaataccacagaactc | format : html | download : | debug : 

0.008 | 0.008 | search_start;
0.183 | 0.175 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AGAGCGGCAAATACCACAGAACTC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.368 | 0.184 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GAGTTCTGTGGTATTTGCCGCTCT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.370 | 0.003 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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