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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2026-01-07 11:39:32, GGGenome : DDBJ release 138.0 (Jun, 2025)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Solanum tuberosum cultivar P8 chromosome 8.
CP046686.1:53546947-53546966
TAATGTATATGGCAATGCTAATGGCACTGC53546947AGTTGGTATTGCTCCTCTTGCCCATATAGCCATATATAAGGTATGTAATT
Solanum tuberosum cultivar MSH/14-112 chromosome 8.
CP046701.1:53545625-53545644
TAATGTATATGGCAATGCTAATGGCACTGC53545625AGTTGGTATTGCTCCTCTTGCCCATATAGCCATATATAAGGTATGTAATT
Epinephelus fuscoguttatus DNA, LG3, complete sequence.
AP022677.1:32154992-32155011
AAAGGCCTTTAGGATATAAAGTGCATTAAA32154992AGTTGGTATTGCTCCTCTTGTTAATTCTTAACCAAAAAATTTGATGATAT
GP173 Solanum tuberosum genomic sequence library GP Solanum tuberosum genomic clone GP173, genomic survey sequence.
CG783104.1:631-650
AATTACATACCTTATATATGGCTATATGGG631CAAGAGGAGCAATACCAACTGCAG
Lissotriton helveticus genome assembly, chromosome: 4_2.
OZ180049.1:127993130-127993149
AGTGGGAGATGATTCTAACAAAACCACCAC127993130CAAGAGGAGCAATACCAACTTTTCTTCAGTGAGGCACTAGCATTTACTCT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/agttggtattgctcctcttg
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : agttggtattgctcctcttg | format : html | download : | debug : 

0.018 | 0.018 | search_start;
0.511 | 0.493 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50800/match?q=AGTTGGTATTGCTCCTCTTG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.619 | 0.108 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50800/match?q=CAAGAGGAGCAATACCAACT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=47
0.622 | 0.003 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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