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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
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2025-04-03 15:14:09, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Capsicum annuum Takanotsume DNA, chromosome 1, sequence.
AP026696.1:198651093-198651116
AATGCAGCAACTTGGAGCATAATTTGCCAG198651093ATAGTCCGTTTGCATCTCCTAAAGCAGTTGGAGACTTCAGCACAACTTTCTCAA
Capsicum annuum cultivar G1-36576 isolate CaT2T chromosome 1.
CP124731.1:197819418-197819441
AATGCAGCAACTTGGAGCATAATTTGCCAG197819418ATAGTCCGTTTGCATCTCCTAAAGCAGTTGGAGACTTCAGCACAACTTTCTCAA
TSA: Capsicum annuum MGMT_Contig23128, mRNA sequence.
JW073372.1:1049-1072
TTGAGAAAGTTGTGCTGAAGTCTCCAACTG1049CTTTAGGAGATGCAAACGGACTATCTGGCAAATTATGCTCCAAGTTGCTTTCTT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/atagtccgtttgcatctcctaaag
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : atagtccgtttgcatctcctaaag | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.224 | 0.215 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ATAGTCCGTTTGCATCTCCTAAAG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.340 | 0.117 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CTTTAGGAGATGCAAACGGACTAT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.341 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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