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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-15 22:07:08, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

GP295 Solanum tuberosum genomic sequence library GP Solanum tuberosum genomic clone GP295, genomic survey sequence.
CG783225.1:67-89
GTACTTCAATTTGTCGTATGAAATATCTTT67ATATCGTTTAAGGCTCCGATTAGATAGTCCCAATTTACTCTCTTGGCTTCAAG
535477 Solanum DArT library Solanum bulbocastanum/Solanum commersonii mixed library genomic, genomic survey sequence.
KG962717.1:65-87
GTACTTCAATTTGTCGTATGAAATGTCTAT65ATATCGTTTAAGGCTCCGATTAGATAGACCCAATTTACTCTCTTGGCTTCAAG
Solanum pinnatisectum cultivar CGN17745 chromosome 3.
CP047566.1:60747132-60747154
CTTGAAGCCAAGAGAGTAAATTGGGACTAT60747132CTAATCGGAGCCTTAAACGATATATAGATATTTCATACGACAAATTGAAGTAC
Solanum tuberosum cultivar Solyntus chromosome 3.
CP055236.1:62228161-62228183
CTTGAAGCCAAGAGAGTAAATTGGGACTAT62228161CTAATCGGAGCCTTAAACGATATATAGACATTTCATACGACAAATTGAAGTAC
Solanum verrucosum cultivar 11H23 chromosome 3.
CP133614.1:57445152-57445174
CTTGAAGCCAAGAGAGTAAATTGGGACTAT57445152CTAATCGGAGCCTTAAACGATATATAGACATTTCATACGACAAATTGAAGTAC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/atatcgtttaaggctccgattag
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : atatcgtttaaggctccgattag | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.249 | 0.240 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ATATCGTTTAAGGCTCCGATTAG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.344 | 0.095 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CTAATCGGAGCCTTAAACGATAT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.346 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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