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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-17 02:56:51, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Porphyra yezoensis cDNA clone:PM004c05_r, 5' end.
AV431692.1:49-67
AGAGTACACCGTTCACGGAGCGCTGCCCCT49CACAAAGGCGCAGTGCTATACGGCAAGGGCCCATCGGTGGCAACCAAAA
Porphyra yezoensis cDNA clone:PM013b05_r, 5' end.
AV432311.1:40-58
AGAGTACACCGTTCACGGAGCGCTGCCCCT40CACAAAGGCGCAGTGCTATACGGCAAGGGCCCATCGGTGGCAACCAAAA
Porphyra yezoensis PyACT3 mRNA for actin, complete cds.
AB126237.1:1407-1425
TTTTGGTTGCCACCGATGGGCCCTTGCCGT1407ATAGCACTGCGCCTTTGTGAGGGGCAGCGCTCCGTGAACGGTGTACTCT
Ceriagrion tenellum genome assembly, chromosome: 4.
OY720635.1:81635573-81635591
TATTGTAATTTTCCAGAAAATTCAGGGCCA81635573ATAGCACTGCGCCTTTGTGATAATCTGTGTTTTGGTGGTTTTCCAGATC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/cACAAAGGCGCAGtGCTAT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : cACAAAGGCGCAGtGCTAT | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.366 | 0.358 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CACAAAGGCGCAGTGCTAT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.463 | 0.096 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ATAGCACTGCGCCTTTGTG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.464 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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