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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 15:34:07, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Ipomoea nil cDNA clone:jmsf32m13, 5' end.
CJ745809.1:322-345
AAAATAACCTTAAAAAAATGGGGTTTTTGA322GCTTGTTTGGTGTTGTTCTGGTTGGTTTGATAGTAAGGTCTCAGCTAGGTAGTG
Ipomoea nil mRNA, clone: JMFS058D10, 5' end sequence, expressed in flower and flower bud, cultivar: Tokyo-kokei standard.
HY940449.1:462-485
AAAATAACCTTAAAAAAATGGGGTTTTTGA462GCTTGTTTGGTGTTGTTCTGGTTGGTTTGATAGTAAGGTCTCAGCTAGGTAGTG
Ipomoea nil mRNA, clone: JMFS135B05, 5' end sequence, expressed in flower and flower bud, cultivar: Tokyo-kokei standard.
HY946357.1:105-128
AAAATAACCTTAAAAAAATGGGGTTTTTGA105GCTTGTTTGGTGTTGTTCTGGTTGGTTTGATAGTAAGGTCTCAGCTAGGTAGTG
Ipomoea nil mRNA, clone: JMFS154H03, 5' end sequence, expressed in flower and flower bud, cultivar: Tokyo-kokei standard.
HY947885.1:496-519
AAAATAACCTTAAAAAAATGGGGTTTTTGA496GCTTGTTTGGTGTTGTTCTGGTTGGTTTGATAGTAAGGTCTCAGCTAGGTAGTG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/caaccagaacaacaccaaacaagc
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : caaccagaacaacaccaaacaagc | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.261 | 0.252 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CAACCAGAACAACACCAAACAAGC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.715 | 0.454 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GCTTGTTTGGTGTTGTTCTGGTTG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.718 | 0.003 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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