GGGenome Help | English

データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 16:24:16, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Ipomoea nil cDNA clone:jm34f03, 5' end, single read.
BJ561594.1:19-42
GAACTACATACTATACCA19CCCGCCCTTCTATTATTCATCCATCACTTACTTAGTTTGTGTTTCTCTCTCCCT
Ipomoea nil cDNA clone:jmsf30d07, 5' end.
CJ744898.1:15-38
GGCATACTATACCA15CCCGCCCTTCTATTATTCATCCATCACTTACTTAGTTTGTGTTTCTCTCTCCCT
Ipomoea nil cDNA clone:jmsf30e23, 5' end.
CJ744934.1:20-43
GGAACTACATACTATACCA20CCCGCCCTTCTATTATTCATCCATCACTTACTTAGTTTGTGTTTCTCTCTCCCT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/cccgcccttctattattcatccat
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : cccgcccttctattattcatccat | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.239 | 0.230 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CCCGCCCTTCTATTATTCATCCAT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.347 | 0.108 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ATGGATGAATAATAGAAGGGCGGG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=47
0.347 | 0.000 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).