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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 12:57:58, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

KS15058C08 KS15 Capsicum annuum cDNA, mRNA sequence.
GD068839.1:195-216
CCATTCGATATCCGATATTCATATTAGAGT195CCGATTAATCTTGATTTGAGCCAAATCGGGCCCATTCGGGGTAGCCTCCCTA
KS21062O04 KS21 Capsicum annuum cDNA, mRNA sequence.
GD104772.1:190-211
CCATTCGATATCCGATATTCATATTAGAGT190CCGATTAATCTTGATTTGAGCCAAATCGGGCCCATTCGGGGTAGCCTCCCTA
TSA: Capsicum annuum MGMT_Contig24962, mRNA sequence.
JW075206.1:641-662
TAGGGAGGCTACCCCGAATGGGCCCGATTT641GGCTCAAATCAAGATTAATCGGACATTAATATGAATATCGGACATCGAATGG
Capsicum annuum Takanotsume DNA, chromosome 8, sequence.
AP026703.1:172987570-172987591
TGGGGAGGCTACCCCGAATGGGCCCGATTT172987570GGCTCAAATCAAGATTAATCGGACTCTAATATGAATATCGGATATCGGATAT
Capsicum annuum cultivar G1-36576 isolate CaT2T chromosome 8.
CP124724.1:184801710-184801731
TAGGGAGGCTACCCCGAATGGGCCCGATTT184801710GGCTCAAATCAAGATTAATCGGACATTAATATGAATATCGGACATCGAATGG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/ccgattaatcttgatttgagcc
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : ccgattaatcttgatttgagcc | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.354 | 0.345 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CCGATTAATCTTGATTTGAGCC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.469 | 0.115 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GGCTCAAATCAAGATTAATCGG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.471 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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