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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 12:18:45, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Ipomoea nil cDNA clone:jm12i07, 5' end, single read.
BJ553928.1:3-27
AT3CCTTCGTGAGTGCTCAATACAGACAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG
Ipomoea nil cDNA clone:jm26b06, 5' end, single read.
BJ558593.1:3-27
AT3CCTTCGTGAGTGCTCAATACAGACAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG
Ipomoea nil cDNA clone:jmsf16i06, 5' end.
CJ739288.1:24-48
GGCGATATTTGCGATTGACTTAT24CCTTCGTGAGTGCTCAATACAGACAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG
Ipomoea nil mRNA, clone: jm51k08, 5' end sequence, expressed in flower and flower bud, cultivar: Tokyo-kokei standard.
HY926852.1:21-45
GATATTTGCGATTGACTTAT21CCTTCGTGAGTGCTCAATACAGACANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/ccttcgtgagtgctcaatacagaca
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : ccttcgtgagtgctcaatacagaca | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.341 | 0.332 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CCTTCGTGAGTGCTCAATACAGACA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.460 | 0.119 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TGTCTGTATTGAGCACTCACGAAGG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=46
0.460 | 0.000 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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