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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 15:54:27, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Ipomoea nil cDNA clone:jmsf35d08, 5' end.
CJ746673.1:194-217
CCCCTCTGAATTCCCCATATTCTTTCTTAT194ATTCTTCCTTGCTGATCATCTCCGCAACCCCCCCCAAAAAAAAAA
Ipomoea nil mRNA, clone: jm43f21, 5' end sequence, expressed in flower and flower bud, cultivar: Tokyo-kokei standard.
HY923829.1:143-166
CCCCTCTGAATTCCCCATATTCTTTCTTAT143ATTCTTCCTTGCTGATCATCTCCGCAACCCCCCCC
Ipomoea nil mRNA, clone: JMFS048G08, 5' end sequence, expressed in flower and flower bud, cultivar: Tokyo-kokei standard.
HY939666.1:134-157
CCCCTCTGAATTCCCCATATTCTTTCTTAT134ATTCTTCCTTGCTGATCATCTCCGCAACCCCCCCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNN

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/cggagatgatcagcaaggaagaat
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : cggagatgatcagcaaggaagaat | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.099 | 0.091 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CGGAGATGATCAGCAAGGAAGAAT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.353 | 0.254 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ATTCTTCCTTGCTGATCATCTCCG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.356 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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