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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 15:53:26, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Erinaceus europaeus genome assembly, chromosome: 20.
OX485830.1:4487384-4487407
AGTGCCAGATATTCAATTCAGAGATTGACA4487384GCTGCTTCCGCAAAGTTCATATTCTAATGAACACAAACAAGTAAACTAACACTG
Ipomoea nil cDNA clone:jmsf30b05, 5' end.
CJ744852.1:78-101
AACGGCAGCCCGACCCGACTCTCCCGCGCC78GCTGCTTCCGCAAAGTTCATATTCGTATACACTGTGTGTGGAAATATTTTTGCA
Ipomoea trifida cultivar NCNSP0306 chromosome 13.
CP025656.1:19863591-19863614
TCTGCAAAATATTTTCACACACATGTATAC19863591GAATATGAACTTTGCGGAAGCAGCGGCGCGGGAGAGTCGGGTCGGGCGGACGTT
Ipomoea triloba cultivar NCNSP0323 chromosome 13.
CP025672.1:28113655-28113678
TCTGCAAAATATTTTCACACACATGTATAC28113655GAATATGAACTTTGCGGAAGCAGCGGCGCGGGAGAGTCGGGTCGGGCGGACGTT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/gctgcttccgcaaagttcatattc
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : gctgcttccgcaaagttcatattc | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.196 | 0.187 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GCTGCTTCCGCAAAGTTCATATTC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.281 | 0.086 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GAATATGAACTTTGCGGAAGCAGC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.283 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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